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por yiseth jaimes hace 4 años

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GENÓMICA DE POBLACIONES

El análisis estadístico de la genómica de poblaciones se enfoca en desarrollar métodos que permitan entender la diferenciación genética y los procesos evolutivos. Un ejemplo claro es el estudio del maíz, que fue domesticado a partir del teosinte mediante selección artificial para adaptarse a diversas condiciones ambientales.

GENÓMICA DE POBLACIONES

GENÓMICA DE POBLACIONES

Ejemplos de genómica de poblaciones

Estudios en bacterias
Se estudio la isla de la patogenicidad la cual es responsable de convertir bacterias no dañinas en bacterias patógenas que producen enfermedades.
Pinus taeda
Se buscaron genes relacionados con las adaptaciones al estrés hídrico del pino
Arabidopsis lyrata
Se compararon 100 plantas de 4 poblaciones y se vio su adaptación a dos tipos de suelos
El pez espinoso
Gasterosteus acualeatus

Se realizaron estudios con el fin de ver la adaptabilidad de este pez al agua dulce

El caso del maíz y sus parientes silvestres, los teosintes

El maíz cultivado (Z.m. mays) fue domesticado a partir del teosinte de las tierras bajas (Z.m. parviglumis)
Seguido de un mejoramiento continuo a lo largo de mucho tiempo

Para responder a las diferentes condiciones ambientales de donde se cultiva el maíz y sus usos.

Primero por un proceso intenso de selección artificial

Biologia de la conservacion

Una de las aplicaciones mas interesantes de la genómica de poblaciones es a la biología de la conservación
•Con métodos genómicos se podrá decidir cuales especies son genéticamente diferentes.
•Uno de los principales efectos de la reducción de poblaciones es el apareamiento entre parientes.
•Por diversas razones una gran cantidad de especies se encuentran en peligro.

Es por eso que es necesario el uso de la genómica para a estas especies a adaptarse.

Mejoramientos de especies

Con el fin de generar estrategias de desarrollo que ayuden a mejorar las variedades cultivadas modernas
las cuales estarán mejor adaptadas al ambiente.
Es importante el uso de genomas ya conocidos para mejorar a otras especies de interés

Ciencias forestales

se están implementando métodos de genómica que permitan identificar alelos que ayuden a ciertas especies como los árboles a adaptarse
Frente a:

Cambios ambientales

Cambios atmofericos

La medicina

Las enfermedades tienen bases genéticas complejas
Están determinadas por

Muchos genes

El ambiente

Es posible que las bases genéticas para una enfermedad sean diferentes en distintas poblaciones

Ideas básicas del análisis estadístico de la genómica de las poblaciones

Desarrollo de los métodos estadísticos e informativos
Se han desarrollado métodos coalescentes mas robustos
Genes que están bajo selección balanceadora deberían tener niveles de diferenciación mas bajos que los neutrales

Los nuevos métodos moleculares

Plataformas next-gen
Se dividen en dos grupos

Los que generan lecturas cortas en mayor cantidad

Aquellos que generan lecturas largas pero en menor cantidad

Métodos next-gen
Es posible añadir códigos genéticos individuales a los fragmentos de ADN o ARN
La obtención de fragmentos de ADN se realiza con diferentes técnicas clásicas de la biología molecular
Al no necesitar marcadores particulares es posible estudiar genomas de organismos no modelo
Estos nuevos métodos nos permiten secuenciar múltiples partes del genoma

Genómica de poblaciones

El desarrollo técnico ha hecho posible la complicación de las capacidades de secuenciación genética de manera vertiginosa
El genoma completo de los organismos es un importante archivo de toda su historia evolutiva
Las regiones promedio del genoma, con variación genética intermedia
Hablan de la historia evolutiva general de las poblaciones

La lucha por medir la variación genética

Daniel Piñero y Maria Artega
Analizan en una colección de maíces de diferentes razas 47 mil marcadores SNPs

Distribuidos a lo largo de los 10 cromosomas del maíz

Complejo de Agave Deserti
Altos niveles de variación dentro de las poblaciones
Claras señales de la diferenciación genética entre poblaciones

Primeros marcadores genéticos

Los análisis de electroforesis de proteínas tienen varias desventajas
Richard Lewontin y John Hubby
Aplicaron la electroforesis de isoenzima

Separa proteínas según su carga y su tamaño usando un campo eléctrico

Dobzhansky estudió la variación genética en una especie de drosophila
Mendel descubrió como segregaba la variación genética

Genética de la poblaciones

El estudio de los genes en poblaciones ha sido la herramienta mas poderosa para la evolución
Entre más alto sea el flujo genico serán más parecidas las poblaciones
A mayor deriva génica van a ser más diferentes las poblaciones
La deriva génica es el cambio al azar en las proporciones de los alelos en una población
La genética de poblaciones busca entender a los procesos evolutivos a una escala ecológica
Heodosius Dobzhansky
Señaló que nada tiene sentido en la biología sino es a la luz de la evolución