Manejo de Base de datos biológicos

Las técnicas moleculares están asociadas con el dogma central de la biología molecular

Entre éstas técnicas encontramos:

Enzimas de restricción

Se debe tener como base la ingeniería
genética

Enzima degradativa
que reconoce y corta el
ADN al azar en distintos
sitios especificos

Tipo I
Metilación, al reconocer la secuencia corta el DNA al azar en sitios distintos a los de reconocimiento

Tipo II
Solo posee actividad de restricción, no necesita ATP; el corte se efectúa en el sitio de reconocimiento

Tipo III
Actividad de restricción
Se cortan varios nucleótidos lejos del sitio de reconocimiento

Extraídas de bacterias;
actúan como mecanismo de
defensa para degradar
material genético extraño

Cortan los enlaces fosfodiéster
las secuencias a corregir

Plásmidos:
Los plásmidos son moléculas de ADN extracromosómico generalmente circular que se replican de manera autónoma y se transmiten independientemente del ADN cromosómico

Utilizados en las bibliotecas
genómicas

Conjuntos de miles de plásmidos
recombinantes que tienen una secuencia
especifica de DNA

Tienen lecturas las secuencias

El nombre técnico para dichas
secuenciaciones se llaman
"READS"

Para una mejor amplificación hay que aumentar el tamaño de la secuenciación

Finalmente se obtienen una gran cantidad de lecturas en donde se da la secuenciación para los análisis bioinformáticos.

Características deseables de un plásmido;

Una capacidad elevada de
replicación

Tamaño pequeño para incorporar
fragmentos mas grandes en la
secuenciación

Varios sitios de restricción

Clonación de genes

Secuenciación

Electroforesis de Proteínas

PCR