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Hibridación de ácidos nucleicos

La hibridación de ácidos nucleicos es un proceso mediante el cual dos cadenas de ácidos nucleicos se combinan en una única molécula de doble cadena, formando una estructura de doble hélice con bases nitrogenadas ocultas.

Hibridación de ácidos nucleicos

Elaborado por: David Josué Freire Wilson

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Bibliografías

Karp, G. (2014). Biología celular y molecular: Conceptos y experimentos (7a ed. --.).

Biología. Curtis H., Barnes S., Schnek A. y Massarini A. (2008) 7a Edición. Editorial Médica Panamericana.
Salazar Montes, A. M., Sandoval Rodríguez, A. S., & Armendáriz Borunda, J. S. (2013).

Biología molecular: Fundamentos y aplicaciones en las ciencias de la salud (1a. ed.--.). México D.F.: McGraw Hill.

Hibridación

Es un proceso por el cual dos cadenas sencillas de DNA o RNA se unen a través de puentes de hidrógenos paar formar una doble hélice

Requerimientos
Antiparalelas: La dirección de la cadena molde debe ser 3`a 5`, mientras que la de la cadena complementaria debe ser 5`a 3`
Complementarias: Sus bases nitrogenadas deben complementarse de forma A-T (2 puentes de H) y G-C (3 puentes de H)
Principalmente se necesita que ambas cadenas de DNA o RNA sean complementarias y antiparalelas.
Usos
Identificación de genes: Al sintetizar una cadena complementaria y antiparalela de un gen, es posible encontrarlo en una prueba molecular usando hibridación de la secuencia artifical con la que se encuentra en el genoma humano.
Medicina forense: Con este proceso se puede cuantificar la similitud entre dos cadenas de DNA y así ubicar parientes de personas N.N o correlacionar muestras con personas.
PCR: En el proceso de reacción de cadena con polimerasa, en la primera etapa, se hace una hibridación del primer que utilizamos con la cadena de DNA que se usa

Así la localización de la secuencia de nucleótidos que se va multiplicar exponencialmente es específica.

Hibridación de ácidos nucleicos

Es un proceso por el cual se combinan dos cadenas de ácidos nucleicos anti-paralelas y con secuencia de bases complementarias, en una única molécula de doble cadena, que toma la estructura de doble hélice, donde las bases nitrogenadas quedan ocultas en el interior.

Técnicas de hibridación
Se dividen en 3

Hibridación In Situ

Hibridación In Situ cromosómica

Se realiza sobre preparaciones de cromosomas metafásicos o prometafásicos, tratadas con reactivos fijadores para preservar las características morfológicas del cromosoma.

Se trata la muestra con enzimas proteolíticas y se desnaturaliza el DNA mediante calor, álcali o formamida para permitir su hibridación con la sonda

Elevado potencial diagnóstico en cromosomopatías, genes tumorales, virología, trasplantes.

Es una técnica donde se usa una muestra biológica que consiste en cortes de tejido, células o cromosomas de un individuo se fija a un portaobjetos de vidrio y luego se expone a una “sonda”, que es una pequeña secuencia de ADN de una sola hebra marcado con un tinte químico o fluorescente.

Las sondas están marcadas con colorantes fluorescentes

Se realiza sobre cortes de tejido, células intactas, núcleos aislados, etc.

Es usado para detectar virus patógenos

Para diagnosticar células cancerosas como consecuencia de cambios genéticos

Para estudiar cambios en la expresión génica, detectando secuencias en el RNA celular

La detección se realiza por autorradiografía y examen de la película fotográfica bajo el microscopio, o por microscopia de fluorescencia, si se empleó este marcaje para la sonda.

Hibridación en soporte sólido

Permite procesar varias muestras de forma simultánea y facilita el control de la hibridación.

Son válidas para el análisis de ácidos nucleicos y el diagnóstico de enfermedades moleculares con base genética.

Es el método empleado para identificar, de entre varias colonias bacterianas en placas de cultivo con agar, las que contienen un gen o fragmento de DNA de interés bajo la forma de plásmido recombinante

Se divide en

Southern blot

Se utiliza para detectar la presencia de moléculas específicas de ARN en una muestra específica.

Proporciona información sobre moléculas que hibridan. Por ejemplo, su tamaño molecular.

Se utiliza para examinar patrones de expresión génica en tejidos embrionarios y en adultos.

Se utiliza también para caracterizar y cuantificar la actividad transcripcional de un gen determinado en distintas células, tejidos u organismos.

Se usan generalmente para caracterizar la identidad de genes específicos, para localizar regiones codificantes o regiones reguladoras flanqueantes en secuencias clonadas. Por ende, sirve para investigar la organización molecular de las secuencias genómicas.

Para uniones ADN- ARN

Se utiliza para identificar las cadenas de ARN de secuencia semejante al ADN que se usa como sonda.

Se utiliza para obtener información sobre el tamaño de ARN

Además para conocer qué genes están activos formando ARNm, en qué tejidos o tipos celulares.

En este el ARN se extrae y se fracciona en tamaños variables, mediante electroforesis en gel de poliacrilamida o agarosa, en condiciones que mantenga las cadenas de ARN, desnaturalizado.

Northern blot

Para uniones ADN-ADN

Aplicaciones

Se lo utiliza para analizar fragmentos de DNA generados por digestión con enzimas de restricción.

Se prepara ADN con enzima de restricción y los fragmentos se separan por tamaños, mediante electroforesis en un gel.

Luego los fragmentos son desnaturalizados y se separan las 2 hebras componentes de ADN en sus cadenas sencillas.

Posteriormente, el ADN inserto en el gel, es transferido a un filtro de nitrocelulosa, y queda representado una réplica de la disposición de los fragmentos de ADN presentes en el gel.

Finalmente el filtro se incuba, con la sonda; durante la incubación, la sonda se va hibridando a las moléculas de ADN de cadena sencilla de secuencia complementaria

Dot - blot y Slot - blot

Es el método más simple y común, gracias a la posibilidad de emplearlo con muestras de ácido nucleico sin purificar.

La muestra se aplica, bien gota a gota (dot-blot) o en manchas alargadas (slot.blot)

sobre un "filtro" de nailon o nitrocelulosa, cuyas propiedades de adsorción fijan las moléculas de ácido nucleico y proteína.

Hibridación en fase líquida

Esta utiliza una muestra de DNA o RNA, en disolución, además se realiza la hibridación con la sonda