Structure des virus

Virus nu: qui ne possède pas de peplos

Virus enveloppé: qui possède un peplos

Structure souple et, de fait, l'enveloppe est acquise lorsque le nucléocapside trverse l'une des membranes de la cellule hôte.

Membrane cytoplasmique (cas le plus fréquent)

Membrane nucléaire

Membrane du réticulum endoplasmique

Spicules: glycoprotéique

Elles portent les déterminants qui reconnaissent les récepteurs celullaires

Certaines favorisent la fusion de l'enveloppe avec la membrane celullaire par l'action d'une séquence d'acides aminés hydrophobes

Certaines peuvent exercées des activitées enzymatiques

Elle peut exercée successivement la reconnaissance et la fusion

La matrice: la face interne de l'enveloppe est tamisée par la matrice ( couche plus ou moins importante de protéines virales)

Elle renforce la double couche lipidique et stabilise la nucléocapside

Elle intervient dans l'assamblage des futurs particules virales grâce à ses relations avec les spicules et la nucléocapside.

Taille entre 3 et 300 Kb

1 Kb = 300 codons, une protéine

Certains augmentent la capacité de codage car ils ont des gènes chevauchants

Un même segment peut traduire plusieurs protéines

ADN

Le plus souvent:

Bicatenaire

Soit linéaire

Soit circulaire

Rarement:

Partiellement bicatenaire et circulaire

Monocatenaire

La taille varie de 3 à 280 Kb

ARN

Le plus souvent:

Monocatenaire

Soit linéaire

Soit segrmenté

Rarement:

Bicatenaire segmenté

Taille moyenne de 15 Kb

A l'heure actuelle il y'a 3 ordes, 55 familles, 9 sous familles, 233 genres et 1550 espèces qui sont redivisés par sérotypes.

Première classification utilisée

Le tropisme (virus animaux, végétaux,...)

Mode de transmission (Arbovirus)

En 2000 l'officialisation de la classification des virus est mise sur les caractères physico-chimiques

Nature du génome

Présence ou absence d'enveloppe

Symétrie de la capside

Un génome modeste

ARN Monocatenaire : fragile

La taille du génome ne doit pas dépasser une certaine limite sinon les risques de cassures sont importants. Une cassure entraîine l'inactivation du virion. Certains ont segmentés le génome pour palier au problème, cependant un autre est survenu: le réassortiment exact. Car chaque virion doit possédé un examplaire de chacun de ses segments sinon il est inactivé.

ARN polymérase: imprécise vs ADN polymérase

Les virus à ARN ne peuvent pas utilisés l'ARN polymérase

L'ARN polymérase est faite grâce à un ADN dépendant, donc elle ne peut être transcrite que par de l'ADN.

Le virus ARN doit donc être capable de fabriquer une transcriptase ARN dépendante.

La cellule ne possède pas de système de réparation de l'ADN.

Le taux de mutations est très élevé, en moyenne il y'a 1 nucléotide érroné pour 1000 à 10 000 nucléotides recopiés. Un génome de 100 Kb ( 10^5 bases) comporterait 10 à 100 mutations. Certaines de ces mutations seraient létales.

Les ARN polymérases virales n'ont pas de fonctions de reléctures

Le taux de mutations du virus à ARN est un avantage car l'apparition fréquente de mutants permet au virus d'échapper au système immunitaire de l'hôte.

Virus à ADN qui utilise l'ADN polymérase de la cellule

L'ADN polymérase dispose d'une relecture. Si le nucléotide incorporé est incorrect, il est donc immédiatement détruit par l'enzyme.

Il y'a donc de nombreux systèmes de réparation de l'ADN dans la cellule. Le taux de mutation est donc très faible: 1 nucléotide pour 10 millions à 1 milliard de nucléotides recopiés.

ARN+ et ARN-

ARN seul du virus poliomyélitique est introduit dans une cellule sensible.Celle ci fabrique les particules virales complètes comme si elle avit été inféctée par le virion.

L'ARN seul du virus de la rage est introduit dans une cellule sensible. La cellule ne fabrique aucune particule virale, l'ARN seule n'est donc pas inféctieuse ( ARN-)

Segmentation du génome

2 virus à génome segmenté appartenant à la même espèce, mais génétiquement différente, peuvent inféctés simultanément une même cellule et s'y multiplier. Au moment de l'assemblage des virions, le réassortiment des segments génétiques peut donner naissance à un nouveau virus.

Sujet secondaire

Capside tubulaire hélicoidale

C'est un tube enroulé en peloton (ce peloton est lui même enveloppé dans un troisième élément nommé peplos)

Capside icosaédrique

Polyèdre à 20 faces qui sont des triangles équilatéraux et 12 sommets vu sous un certain angle, l'icosaèdre présente un contour héxagonal (très stable)

Capside complexe

2 Groupes de virus d'ADN bicaténaires ont un génome de grande taille, ce qui leur offre des capacités de codage étendues. Ces virus représentent, en microscopie éléctronique, des morphologies complexes qui les excluent des capsides hélicoidales et icosaèdriques ( VIH ou pox virus)

Caspide à symétrie non déterminée: lentivirus

Sous famille des rétro-virus notamment VIH. Leur capside prend un aspect "tronc de cône" caractéristique mais qui reste à définir complètement.