MARQUEURS Moléculaires
Séquence (codante ou non) d'ADN possédant une position physique identifiable et dont l’hérédité peut-être suivie
Polymorphisme de séquence d’ADN
Utilisation
Estimation et mesure de la diversité au sein d’une espèce ou d’un complexe d’espèce
Marquage et prédiction
CARTE GENETIQUE
Marquage de caractères d’intérêt Agronomique = Détection QTL
Constructions de génotypes
Exemple : Introgression d’un gène dans une variété élite
SSR = Simple Sequence Repeats (micro-sat)
Séquences d’ADN répétées en tandem
Abondants (1 SSR tous 21kb pour les dicotylédones et 65kb
pour les monocotylédones)
Répartis sur l’ensemble du génome (région inter-génique,
promoteur, exon, intron…)
Spécificité de locus
Polymorphisme de type : nombre d'unité de répétition
- mononucléotide : An ou Cn
- dinucléotide : (CA)n , (GA)n , (TA)n, (CG)n, (TC)n
- trinucléotide : (TAT)n
- tétranucléotide (GATA)n
INCONVENIENTS & AVANTAGES
Procédure de découverte complexe
Très abondants sur le génome
Utilisation simple et rapide
Codominants
-->Distinction des individus hétérozygotes
Polymorphisme élevé
-->Mesure et structuration de la diversité
Technique très reproductible
Facilement automatisé, permettant le multiplexage
SNP= Single Polymorphisme Nucleotide
Polymorphisme de type : un seul nucléotide
Transition : remplacement entre purine (A,T) ou pyrimidines (G,C), c'est 2/3 des SNP
Transversion : Remplacement d'une purine par une pyrimidine ou vice versa