訂做你的阿凡達:光磁控遠端神經操作
(Tailoring Your Avatar
--Optomagnetogenetic Tele-Neurocontrol)
A組(Panel A)
[磁控發光蛋白機制]
Mms13蛋白質結購模擬
ExPASy tertiary structure modeling tools
SWISS-MODEL
Mms13 no template
Luciferase
Phyre
Phyre(original)
Mms13--124 a.a. version
Mms13--145 a.a. version
Phyre 2
Normal
Mms13--124 a.a. version
Mms13--145 a.a. version
Intensive
Mms13--124 a.a. version
Mms13--145 a.a. version
SOSUI(transmembrane helix prediction)
PoPMuSiC
CHARMM
"Membrane Protein" Coarse-Grain Modeling
Find structures similar to Mms13 in data bank
Use possible modeling program for Mms13
蛋白質工程設計
蛋白質結構測定(在modeling結果不滿意時採行之)
向日本詢問:當年Mms13結構判定實驗,與概念確定的過程
剔除某些片段以進行蛋白質功能結構測試(證實modeling結果)
"turn" modification
Comfirmation & Observation Paradigm
Anticipated Results
"helix" knock-out
Comfirmation & Observation Paradigm
Anticipated Results
蛋白質工程進行(modeling結束後;或是結構測定相關實驗結束後)
Directed Mutagenesis:Oligonucleotide - directed method
Protein model
model1
model2
genetically structure template
cloning操控:加長helix(?)
發光閃爍性質進階測試(核心實驗步驟)
FRET (using YFG & GFP as flanking sequence of Mms13)→detect proximity of N- and C-
split-lucierase complementation
B組(Panel B)
[神經免疫反應調控]
胞內共生機制與資料查詢
電子書閱讀
Central Nervous System Diseases and Inflammation
Bacterial Invasion of Host Cells
Bacterial Evasion of Host Immune Responses
Phagocytosis of Bacteria and Bacterial Pathogenicity
Listeria Monocytogene genes
InlA (induces phagocytosis)
LLO (lyses phagosome membrane)
Hpt (G-6-P importase)
要plasmid《快!》
國外?《快上加快,不然會來不及!!!》
中研院
clone基因進入pKML並表現於AMB-1上
選promotor!
利用homologous recombinant進入bacteria genomic DNA中
篩選(耗時)
截切方式檢驗insertion的成功與否
跨段落PCR:檢驗insertion的邊界是否正確
培養microglia、macrophage
in vitro testing(關鍵核心實驗)
intracellularity fitenss measurement
cytokines releasing amount measurement
Main topic
C組(Panel C)
[趨磁菌基因浮水印計畫]
密碼學(cryptography)
台大陳君明老師
密碼學課程講義
抽象代數導論
各類編碼方式研討
最適DNA之編碼方式
基因工程編碼解碼設計
重要領域:DNA computing
電子書:DNA computing models
電子書:Theoretical and Experimental DNA Computation
電子書:DNA Computing and Molecular Programming--15th International Conference
電子書:13th International Meeting on DNA Computing
電子書:14th International Meeting on DNA Computing
電子書:9th International Workshop on DNA Based Computers
電子書:8th International Workshop on DNA Based Computers
電子書:7th International Workshop on DNA Based Computers
電子書:6th International Workshop on DNA Based Computers
2010年香港中文大學"Bioencryption by recombination"
Adleman實驗的終極應用:雙重防護密碼+編碼系統
C'組(Panel C')
[前導實驗與先行分子生物基礎建立]
magnetospirillum magneticum (AMB-1)菌種培養試驗
AMB-1的替代品:magnetospirillum magnetotacticum (MS-1)
magnetospirillum
寫信事宜
基因改造承載質體pUMG與相關方法
改換成pRK415做為改造原料(成品:pKML)
加上Apr之類的抗性篩選因子
加上Pmsp3 (超強promotor)
不能的話則先用Biobrick材料來test
加上Luc或EGFP之類的基因,或加上適當的anchoring protein,測定大腸桿菌內表現活性。
若AMB-1已寄送到,則可直接開始測定日本原先Mms13做為anchor之實驗的construct可正常表現與否
Magnetospirillum magneticum (AMB-1)向法國吳龍飛教授取得
養菌條件
MSGM
The medium receipt
liquid or solid (with argarose) medium?
Nitrogen gas & fermentor
低氧養菌槽(借用)
自製培養箱
Lock-Lock最大號保鮮盒
冷氣用軟管
有力的鐵夾
熱熔膠槍
氮氣鋼筒(借用)
養氣電極(借用)
養菌時間
D組:(Panel D)
[網頁呈現、科學視覺化、科學藝術]
Members:
傳胤(組長)、建宏、章樺、嚶蓮、尚叡、顥馨
1. Schema and concept design confirmation.
2. Public Team Wiki製作
1. 風格
2. 架構
3. 與Reference Web Project的結合
3. 影片製作
1. 風格
2. 內容
3. 器材
4. 動畫
5. 後製
4. 多媒體編輯工具學習
Mediawiki, AI, PS, AutoCAD, Aftereffect, 代工
5. 會議記錄製作
攝影、紀錄
F組(Panel F)
[贊助廠商與支持來源搜尋]
1. 修改Proposal
2. Proposal寄送及聯繫sponsors
3. 統計及彙整
E組(Panel E)
[神經道德學探討、生物倫理學]
相關議題
神經操控的合理性
增強(Enhancement)
治癒(Therapy)
治療所要保持的理性判斷範圍
精神病人的治療屬於增強抑或是治療
精神病人的社會層面
造成社會外部效果?增強?
精神病人病理層面
有感精神病人
無感精神病人
必要與非必要性
良好選擇
理性的範圍與定義
什麼程度稱為理性
邏輯
前因後果
對錯
議題對或錯
全對全錯
相容性
自由意志
什麼樣的條件構成自由意志與理性
視覺?
嗅覺
聽覺?
各大腦區?
主軸
在正確的時間.狀況做允許的影響行為
理性判斷
自由意志
比例原則
安全性
標準操作流程
犯罪與濫用
操縱人心?
進入迷流狀況 不願回到現實?
(Inception)
資訊安全
短期
中期
長期
當前討論結構_尚叡部份
宗教問題
神給予人意志?
2011 iGem沙龍晚會
(Salon de l'Avatar)
各組設計詳細報告
E組帶領分組討論
神經道德學
人的機械化
身體概念的重塑
合成生物學與生物倫理
強制演化?
扮演上帝?