A molekulák szerkezeti modellezése számos eszközt és módszert használ annak érdekében, hogy a tudósok jobban megértsék az anyagok összetételét és viselkedését. Az atomok típusainak és számának arányától függően különböző modellek készíthetők, amelyek segítenek a jelenségek vizuális szemléltetésében.
