Manejo de Base de datos biológicos

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Manejo de Base de datos biológicos

Las técnicas moleculares están asociadas con el dogma central de la biología molecular

Entre éstas técnicas encontramos:

PCR

Electroforesis de Proteínas

Secuenciación

Clonación de genes

Enzimas de restricción

Plásmidos: Los plásmidos son moléculas de ADN extracromosómico generalmente circular que se replican de manera autónoma y se transmiten independientemente del ADN cromosómico

Características deseables de un plásmido;

Varios sitios de restricción

Tamaño pequeño para incorporar fragmentos mas grandes en la secuenciación

Una capacidad elevada de replicación

Utilizados en las bibliotecas genómicas

Conjuntos de miles de plásmidos recombinantes que tienen una secuencia especifica de DNA

Tienen lecturas las secuencias

El nombre técnico para dichas secuenciaciones se llaman "READS"

Para una mejor amplificación hay que aumentar el tamaño de la secuenciación

Finalmente se obtienen una gran cantidad de lecturas en donde se da la secuenciación para los análisis bioinformáticos.

Se debe tener como base la ingeniería genética

Enzima degradativa que reconoce y corta el ADN al azar en distintos sitios especificos

Cortan los enlaces fosfodiéster las secuencias a corregir

Extraídas de bacterias; actúan como mecanismo de defensa para degradar material genético extraño

Tipo III Actividad de restricción Se cortan varios nucleótidos lejos del sitio de reconocimiento

Tipo II Solo posee actividad de restricción, no necesita ATP; el corte se efectúa en el sitio de reconocimiento

Tipo I Metilación, al reconocer la secuencia corta el DNA al azar en sitios distintos a los de reconocimiento