Fonction de fixation au récepteur cellulaire (igants viraux)
Fonction de protéction: elle protège l'acide nucléique des altérations physiques, chimiques ou enzymatiques.
Structure des virus
Capside: le génome est emballé dans une structure protéique (il protège le génome, ce sont des protéines virales)
Caspide à symétrie non déterminée: lentivirus
Sous famille des rétro-virus notamment VIH. Leur capside prend un aspect "tronc de cône" caractéristique mais qui reste à définir complètement.
Capside complexe
2 Groupes de virus d'ADN bicaténaires ont un génome de grande taille, ce qui leur offre des capacités de codage étendues. Ces virus représentent, en microscopie éléctronique, des morphologies complexes qui les excluent des capsides hélicoidales et icosaèdriques ( VIH ou pox virus)
Capside icosaédrique
Polyèdre à 20 faces qui sont des triangles équilatéraux et 12 sommets vu sous un certain angle, l'icosaèdre présente un contour héxagonal (très stable)
Capside tubulaire hélicoidale
C'est un tube enroulé en peloton (ce peloton est lui même enveloppé dans un troisième élément nommé peplos)
Originalité des virus
Segmentation du génome
Sujet secondaire
2 virus à génome segmenté appartenant à la même espèce, mais génétiquement différente, peuvent inféctés simultanément une même cellule et s'y multiplier. Au moment de l'assemblage des virions, le réassortiment des segments génétiques peut donner naissance à un nouveau virus.
ARN+ et ARN-
L'ARN seul du virus de la rage est introduit dans une cellule sensible. La cellule ne fabrique aucune particule virale, l'ARN seule n'est donc pas inféctieuse ( ARN-)
ARN seul du virus poliomyélitique est introduit dans une cellule sensible.Celle ci fabrique les particules virales complètes comme si elle avit été inféctée par le virion.
Un génome modeste
ARN polymérase: imprécise vs ADN polymérase
Virus à ADN qui utilise l'ADN polymérase de la cellule
Il y'a donc de nombreux systèmes de réparation de l'ADN dans la cellule. Le taux de mutation est donc très faible: 1 nucléotide pour 10 millions à 1 milliard de nucléotides recopiés.
L'ADN polymérase dispose d'une relecture. Si le nucléotide incorporé est incorrect, il est donc immédiatement détruit par l'enzyme.
Les virus à ARN ne peuvent pas utilisés l'ARN polymérase
Le taux de mutations du virus à ARN est un avantage car l'apparition fréquente de mutants permet au virus d'échapper au système immunitaire de l'hôte.
Les ARN polymérases virales n'ont pas de fonctions de reléctures
La cellule ne possède pas de système de réparation de l'ADN.
Le taux de mutations est très élevé, en moyenne il y'a 1 nucléotide érroné pour 1000 à 10 000 nucléotides recopiés. Un génome de 100 Kb ( 10^5 bases) comporterait 10 à 100 mutations. Certaines de ces mutations seraient létales.
L'ARN polymérase est faite grâce à un ADN dépendant, donc elle ne peut être transcrite que par de l'ADN.
Le virus ARN doit donc être capable de fabriquer une transcriptase ARN dépendante.
ARN Monocatenaire : fragile
La taille du génome ne doit pas dépasser une certaine limite sinon les risques de cassures sont importants. Une cassure entraîine l'inactivation du virion. Certains ont segmentés le génome pour palier au problème, cependant un autre est survenu: le réassortiment exact. Car chaque virion doit possédé un examplaire de chacun de ses segments sinon il est inactivé.
En 2000 l'officialisation de la classification des virus est mise sur les caractères physico-chimiques
Symétrie de la capside
Présence ou absence d'enveloppe
Nature du génome
Classification des virus
Première classification utilisée
Mode de transmission (Arbovirus)
Le tropisme (virus animaux, végétaux,...)
A l'heure actuelle il y'a 3 ordes, 55 familles, 9 sous familles, 233 genres et 1550 espèces qui sont redivisés par sérotypes.
Génome
ARN
Taille moyenne de 15 Kb
Bicatenaire segmenté
Soit segrmenté
ADN
La taille varie de 3 à 280 Kb
Rarement:
Monocatenaire
Partiellement bicatenaire et circulaire
Le plus souvent:
Soit circulaire
Soit linéaire
Bicatenaire
Taille entre 3 et 300 Kb
Certains augmentent la capacité de codage car ils ont des gènes chevauchants
Un même segment peut traduire plusieurs protéines
1 Kb = 300 codons, une protéine
Les enveloppes: virus nu, enveloppé
La matrice: la face interne de l'enveloppe est tamisée par la matrice ( couche plus ou moins importante de protéines virales)
Elle intervient dans l'assamblage des futurs particules virales grâce à ses relations avec les spicules et la nucléocapside.
Elle renforce la double couche lipidique et stabilise la nucléocapside
Spicules: glycoprotéique
Elle peut exercée successivement la reconnaissance et la fusion
Certaines peuvent exercées des activitées enzymatiques
Certaines favorisent la fusion de l'enveloppe avec la membrane celullaire par l'action d'une séquence d'acides aminés hydrophobes
Elles portent les déterminants qui reconnaissent les récepteurs celullaires
Virus enveloppé: qui possède un peplos
Structure souple et, de fait, l'enveloppe est acquise lorsque le nucléocapside trverse l'une des membranes de la cellule hôte.
Membrane du réticulum endoplasmique
Membrane nucléaire
Membrane cytoplasmique (cas le plus fréquent)
Virus nu: qui ne possède pas de peplos
