by Lydia R 5 years ago
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MARQUEURS Moléculaires
Les marqueurs moléculaires sont des séquences d'ADN, qu'elles soient codantes ou non, qui possèdent une position physique identifiable et dont l'hérédité peut être suivie. Ils sont utilisés pour le marquage et la prédiction de caractères d'
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SNP= Single Polymorphisme Nucleotide Variation stable de la séquence d'ADN portant sur une
seule base Très fréquentes 2 types d'impact: -séquences codantes -séquences non codantes Polymorphisme de type : un seul nucléotide Transversion : Remplacement d'une purine par une pyrimidine ou vice versa Transition : remplacement entre purine (A,T) ou pyrimidines (G,C), c'est 2/3 des SNP SSR = Simple Sequence Repeats (micro-sat) INCONVENIENTS & AVANTAGES Facilement automatisé, permettant le multiplexage Technique très reproductible Polymorphisme élevé -->Mesure et structuration de la diversité Codominants -->Distinction des individus hétérozygotes Utilisation simple et rapide Très abondants sur le génome Procédure de découverte complexe Polymorphisme de type : nombre d'unité de répétition - mononucléotide : An ou Cn
- dinucléotide : (CA)n , (GA)n , (TA)n, (CG)n, (TC)n
- trinucléotide : (TAT)n
- tétranucléotide (GATA)n Spécificité de locus Répartis sur l’ensemble du génome (région inter-génique,
promoteur, exon, intron…) Abondants (1 SSR tous 21kb pour les dicotylédones et 65kb
pour les monocotylédones) Séquences d’ADN répétées en tandem MARQUEURS Moléculaires Utilisation Constructions de génotypes Exemple : Introgression d’un gène dans une variété élite Marquage et prédiction Marquage de caractères d’intérêt Agronomique = Détection QTL CARTE GENETIQUE Estimation et mesure de la diversité au sein d’une espèce ou d’un complexe d’espèce Polymorphisme de séquence d’ADN Séquence (codante ou non) d'ADN possédant une position physique identifiable et dont l’hérédité peut-être suivie
