Manejo de Base de datos biológicos

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por Antonieta chile

CRISPR/CAS9

1987

2012

Emanuelle Charpenter y Jennifer Duonda

Proponen utilizar esta técnica como edicion genética en varios genes

Permitiendo modificar y editar de forma especifica el codigo genético, llegando a curar enfermedades cuya causa genética es conocida

Especificidad del ARN del crisper no es total y no genera mucha seguridad

De igual forma permite aplicaciones en agricultura mejorando las propiedades de los alimentos

Alimentos trasngénicos

Bacterias Streptococcus Pyogenes eran capaces de defenderse de los virus por que destruian si material genético

Juan Martines Mojica observo que en el ADN de estas bacterias habian unas zonas concretas

Zonas en las cuales habian secuencias qie se repetian y habian segmentos de ADN virico

Técnica de edición genética, capaz de modificar nuestros genes

Modifica histonas y DNA sin modificar la seciancia

Bionformática

Biología computacional

Busca resolver problemas problemas biologicos

Todos los sistemas aplicados a la biología

Colecta, almacena, analisa y manipulan

BIG DATA

Un gran volumen de información que proviene de difreentes sucesos

Velocidad

Valor

Veracidad

Variabilidad

Volumen

PREDECIR FUTURAS SITUACIONES

Manejo de Base de datos biológicos

Las técnicas moleculares están asociadas con el dogma central de la biología molecular

Entre éstas técnicas encontramos:

PCR

Electroforesis de Proteínas

Secuenciación

Clonación de genes

Enzimas de restricción

Plásmidos: Los plásmidos son moléculas de ADN extracromosómico generalmente circular que se replican de manera autónoma y se transmiten independientemente del ADN cromosómico

Características deseables de un plásmido;

Varios sitios de restricción

Tamaño pequeño para incorporar fragmentos mas grandes en la secuenciación

Una capacidad elevada de replicación

Utilizados en las bibliotecas genómicas

Conjuntos de miles de plásmidos recombinantes que tienen una secuencia especifica de DNA

Tienen lecturas las secuencias

El nombre técnico para dichas secuenciaciones se llaman "READS"

Para una mejor amplificación hay que aumentar el tamaño de la secuenciación

Finalmente se obtienen una gran cantidad de lecturas en donde se da la secuenciación para los análisis bioinformáticos.

Se debe tener como base la ingeniería genética

Enzima degradativa que reconoce y corta el ADN al azar en distintos sitios especificos

Cortan los enlaces fosfodiéster las secuencias a corregir

Extraídas de bacterias; actúan como mecanismo de defensa para degradar material genético extraño

Tipo III Actividad de restricción Se cortan varios nucleótidos lejos del sitio de reconocimiento

Tipo II Solo posee actividad de restricción, no necesita ATP; el corte se efectúa en el sitio de reconocimiento

Tipo I Metilación, al reconocer la secuencia corta el DNA al azar en sitios distintos a los de reconocimiento

DATA MINING

EPIGENTICA

EDICION GENICA

Desactivar los genes con el objetivo de corregir mutuaciones y cambiar la actividad de genes específicos

Genetrech producia insulina utilazando la bacteria Eschericgia Coli, cuyo genoma habia sido modificado para albergar un gen humano

Pual Berg logra cortar un fragmento de virus de ADN que infecta bacterias y unirlo a un virus que afecta monos

Estos métodos eran imprecisos y muy costosos

Se desarrollan nucleasas especiales como las talen y dedos de zinc que lograron aumnetar la precision

FUNCIONA

MECANISMOS

No covalente

Que se damediante modificaciones del ADN y tambien de las histonas

Covalente

Elementos quimicos que modifican los genes

EPIGENOMA

Conjunto de todas las marcaciones epigeneticasque estan en el ADN

Esta compuesto por quimicos que modifican o marcan el genoma

Determinan que, donde, y cuando se hace o se expresa un gen.

Mutación del maiz, donde hay una interaccion entre 2 tipos de alelo en cual uno de los alelos causa cambio heridatario en el otro alelo

Se asume frente un medio ambiente, el cual altera la expresión de los genes

Aquellos fenomenos que cambian el reulstado de un gen o cromosoma

Aunque cambIen ese reultado o produccion del complejo de proteinas, no va a cambiar la secuncia del ADN

MEDIO AMBIENTE

Proceso Natural

Funcion en cuanto a: -Lo que somos -Lo que medimos -Lo que observamos -Las cantidades

Rama de la biología que estudia las interacciones causales entre los genes y sus productos

GENES/DNA/FENOTIPO

Tecnicas y tecnologias que nos permiten explorar una gran cantidad de bases de datos

Analisis de resultados

Determinacion de un modelo

Procesamiento de los datos

Determinar cual es el objetivo