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De esta manera se plantea que existen dos circuitos para el procesamiento y respuesta emocional relacionados a la amígdala, el subcortical o directo que va del tálamo a la amígdala y el cortical o indirecto que va del tálamo a diversas áreas corticales y después a la amígdala (Sánchez-Navarro, 2004)
circuito cortical
posee conexiones con múltiples circuitos nerviosos y por ello es menos rápido y más complejo. Su actividad es consciente, precisa, reflexiva y analizada. Procesa representaciones sensoriales más exactas y detalladas. Su función principal es controlar y modular la reacción emocional del circuito subcortical (LeDoux, 1999).
Circuito subcortical
recibe directamente las aferencias sensoriales, es automático, inconsciente e involuntario. Las conexiones que posee son rápidas y de acción imprecisa porque su función principal es preparar al organismo para actuar inmediatamente, sus funciones están ligadas directamente a la supervivencia del organismo (Morgado, 2007)