GENÓMICA DE POBLACIONES
Ejemplos de genómica de poblaciones
Estudios en bacterias
Se estudio la isla de la patogenicidad la cual es responsable de convertir bacterias no dañinas en bacterias patógenas que producen enfermedades.
Pinus taeda
Se buscaron genes relacionados con las adaptaciones al estrés hídrico del pino
Arabidopsis lyrata
Se compararon 100 plantas de 4 poblaciones y se vio su adaptación a dos tipos de suelos
El pez espinoso
Gasterosteus acualeatus
Se realizaron estudios con el fin de ver la adaptabilidad de este pez al agua dulce
El caso del maíz y sus parientes silvestres, los teosintes
El maíz cultivado (Z.m. mays) fue domesticado a partir del teosinte de las tierras bajas (Z.m. parviglumis)
Seguido de un mejoramiento continuo a lo largo de mucho tiempo
Para responder a las diferentes condiciones ambientales de donde se cultiva el maíz y sus usos.
Primero por un proceso intenso de selección artificial
Biologia de la conservacion
Una de las aplicaciones mas interesantes de la genómica de poblaciones es a la biología de la conservación
•Con métodos genómicos se podrá decidir cuales especies son genéticamente diferentes.
•Uno de los principales efectos de la reducción de poblaciones es el apareamiento
entre parientes.
•Por diversas razones una gran cantidad de especies se encuentran en peligro.
Es por eso que es necesario el uso de la genómica para a estas especies a adaptarse.
Mejoramientos de especies
Con el fin de generar estrategias de desarrollo que ayuden a mejorar las variedades cultivadas modernas
las cuales estarán mejor adaptadas al ambiente.
Es importante el uso de genomas ya conocidos para mejorar a otras especies de interés
Ciencias forestales
se están implementando métodos de genómica que permitan identificar alelos que ayuden a ciertas especies como los árboles a adaptarse
Frente a:
Cambios ambientales
Cambios atmofericos
La medicina
Las enfermedades tienen bases
genéticas complejas
Están determinadas por
Muchos genes
El ambiente
Es posible que las bases genéticas
para una enfermedad sean
diferentes en distintas
poblaciones
Ideas básicas del análisis estadístico
de la genómica de las poblaciones
Desarrollo de los métodos estadísticos
e informativos
Se han desarrollado métodos
coalescentes mas robustos
Genes que están bajo selección
balanceadora deberían tener
niveles de diferenciación mas
bajos que los neutrales
Los nuevos métodos
moleculares
Plataformas next-gen
Se dividen en dos grupos
Los que generan lecturas
cortas en mayor cantidad
Aquellos que generan lecturas
largas pero en menor cantidad
Métodos next-gen
Es posible añadir códigos genéticos
individuales a los fragmentos de ADN
o ARN
La obtención de fragmentos de ADN
se realiza con diferentes técnicas
clásicas de la biología molecular
Al no necesitar marcadores particulares
es posible estudiar genomas de
organismos no modelo
Estos nuevos métodos nos
permiten secuenciar múltiples
partes del genoma
Genómica de
poblaciones
El desarrollo técnico ha hecho posible
la complicación de las capacidades
de secuenciación genética de manera
vertiginosa
El genoma completo de los
organismos es un importante
archivo de toda su historia evolutiva
Las regiones promedio
del genoma, con variación
genética intermedia
Hablan de la historia
evolutiva general de las
poblaciones
La lucha por medir
la variación genética
Daniel Piñero y Maria Artega
Analizan en una colección
de maíces de diferentes razas
47 mil marcadores SNPs
Distribuidos a lo largo de
los 10 cromosomas del
maíz
Complejo de Agave
Deserti
Altos niveles de variación
dentro de las poblaciones
Claras señales de la
diferenciación genética entre
poblaciones
Primeros marcadores
genéticos
Los análisis de electroforesis de
proteínas tienen varias desventajas
Richard Lewontin y John Hubby
Aplicaron la electroforesis de
isoenzima
Separa proteínas según su carga
y su tamaño usando un campo
eléctrico
Dobzhansky estudió la variación
genética en una especie de
drosophila
Mendel descubrió como
segregaba la variación genética
Genética de la poblaciones
El estudio de los genes en poblaciones
ha sido la herramienta mas poderosa
para la evolución
Entre más alto sea el flujo genico serán
más parecidas las poblaciones
A mayor deriva génica van a ser más
diferentes las poblaciones
La deriva génica es el cambio
al azar en las proporciones de los
alelos en una población
La genética de poblaciones
busca entender a los
procesos evolutivos a una escala
ecológica
Heodosius Dobzhansky
Señaló que nada tiene sentido
en la biología sino es a la luz de
la evolución
