GENÓMICA DE POBLACIONES

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GENÓMICA DE POBLACIONES

Ejemplos de genómica de poblaciones

Estudios en bacterias

Se estudio la isla de la patogenicidad la cual es responsable de convertir bacterias no dañinas en bacterias patógenas que producen enfermedades.

Pinus taeda

Se buscaron genes relacionados con las adaptaciones al estrés hídrico del pino

Arabidopsis lyrata

Se compararon 100 plantas de 4 poblaciones y se vio su adaptación a dos tipos de suelos

El pez espinoso

Gasterosteus acualeatus

Se realizaron estudios con el fin de ver la adaptabilidad de este pez al agua dulce

El caso del maíz y sus parientes silvestres, los teosintes

El maíz cultivado (Z.m. mays) fue domesticado a partir del teosinte de las tierras bajas (Z.m. parviglumis)

Seguido de un mejoramiento continuo a lo largo de mucho tiempo

Para responder a las diferentes condiciones ambientales de donde se cultiva el maíz y sus usos.

Primero por un proceso intenso de selección artificial

Biologia de la conservacion

Una de las aplicaciones mas interesantes de la genómica de poblaciones es a la biología de la conservación

•Con métodos genómicos se podrá decidir cuales especies son genéticamente diferentes.

•Uno de los principales efectos de la reducción de poblaciones es el apareamiento entre parientes.

•Por diversas razones una gran cantidad de especies se encuentran en peligro.

Es por eso que es necesario el uso de la genómica para a estas especies a adaptarse.

Mejoramientos de especies

Con el fin de generar estrategias de desarrollo que ayuden a mejorar las variedades cultivadas modernas

las cuales estarán mejor adaptadas al ambiente.

Es importante el uso de genomas ya conocidos para mejorar a otras especies de interés

Ciencias forestales

se están implementando métodos de genómica que permitan identificar alelos que ayuden a ciertas especies como los árboles a adaptarse

Frente a:

Cambios ambientales

Cambios atmofericos

La medicina

Las enfermedades tienen bases genéticas complejas

Están determinadas por

Muchos genes

El ambiente

Es posible que las bases genéticas para una enfermedad sean diferentes en distintas poblaciones

Ideas básicas del análisis estadístico de la genómica de las poblaciones

Desarrollo de los métodos estadísticos e informativos

Se han desarrollado métodos coalescentes mas robustos

Genes que están bajo selección balanceadora deberían tener niveles de diferenciación mas bajos que los neutrales

Los nuevos métodos moleculares

Plataformas next-gen

Se dividen en dos grupos

Los que generan lecturas cortas en mayor cantidad

Aquellos que generan lecturas largas pero en menor cantidad

Métodos next-gen

Es posible añadir códigos genéticos individuales a los fragmentos de ADN o ARN

La obtención de fragmentos de ADN se realiza con diferentes técnicas clásicas de la biología molecular

Al no necesitar marcadores particulares es posible estudiar genomas de organismos no modelo

Estos nuevos métodos nos permiten secuenciar múltiples partes del genoma

Genómica de poblaciones

El desarrollo técnico ha hecho posible la complicación de las capacidades de secuenciación genética de manera vertiginosa

El genoma completo de los organismos es un importante archivo de toda su historia evolutiva

Las regiones promedio del genoma, con variación genética intermedia

Hablan de la historia evolutiva general de las poblaciones

La lucha por medir la variación genética

Daniel Piñero y Maria Artega

Analizan en una colección de maíces de diferentes razas 47 mil marcadores SNPs

Distribuidos a lo largo de los 10 cromosomas del maíz

Complejo de Agave Deserti

Altos niveles de variación dentro de las poblaciones

Claras señales de la diferenciación genética entre poblaciones

Primeros marcadores genéticos

Los análisis de electroforesis de proteínas tienen varias desventajas

Richard Lewontin y John Hubby

Aplicaron la electroforesis de isoenzima

Separa proteínas según su carga y su tamaño usando un campo eléctrico

Dobzhansky estudió la variación genética en una especie de drosophila

Mendel descubrió como segregaba la variación genética

Genética de la poblaciones

El estudio de los genes en poblaciones ha sido la herramienta mas poderosa para la evolución

Entre más alto sea el flujo genico serán más parecidas las poblaciones

A mayor deriva génica van a ser más diferentes las poblaciones

La deriva génica es el cambio al azar en las proporciones de los alelos en una población

La genética de poblaciones busca entender a los procesos evolutivos a una escala ecológica

Heodosius Dobzhansky

Señaló que nada tiene sentido en la biología sino es a la luz de la evolución